Con el fin de cumplir perfectamente las múltiples tareas de la Fundación Mundial para las Ciencias Naturales hemos establecido diferentes departamentos. Los directores de cada departamento están a cargo de diversos grupos de proyectos, que están dirigidos por especialistas y que son voluntariamente apoyados por muchos de nuestros miembros.

Actualmente, cientos de personas alrededor del mundo participan y desempeñan un papel activo en estos proyectos.